照常进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（上田祐司 配音）、小霞（饭塚雅弓 配音）一行辗转来到水之都奥多马雷参加紧张刺激的水上竞赛。奥多马雷流传着一个精彩的传说，在很久很久以前，岛上的老夫妇捡到一对孤儿兄妹，当邪魔出现时，两兄妹化作威力强大的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯，他们击败邪魔，并赐予奥多马雷人民名为“心灵水滴”的宝石作为守护。时至今日，神圣的心灵之滴却引起一对盗贼姐妹（释由美子 配音）的垂涎。她们在追踪妹妹拉帝亚斯（折笠富美子 配音）时遭遇小智并受挫，贪欲将带给水都史无前例的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第五部电影剧场版。
田中真弓 大谷育江 冈村明美 中井和哉 山口胜平 平田广明 山口由里子 矢尾一树 岛田敏 沼田祐介 乃村健次 小野健一 青野武 藤本隆弘 金光祥浩 织田优成 冈本宽志 松本考平 中山真奈美 中尾良平 森岳志 田中大文 安田早希 齐藤贵美子 井上美纪 大场真人 野泽雅子 牛山茂
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